El colegio Militar fue creado el 27 de agosto de 1943, mediante Decreto Ley, por el Presidente Constitucional Dr. Manuel Prado Ugarteche y el Ministro de Educación Dr. Elías Laroza. Nace como Colegio Militar Nacional para fomar a los cadetes con una elevada cultura cívica y militar.

El 18 de enero de 1944 a través de la Ley 9890, se le denominó "Leoncio Prado" y el 15 de julio, del mismo año se inauguró oficialmente sus labores académicas. Su primer Director fue el Coronel José Del Carmen Marín Arista.

Desde entonces ha entregado a la Nación ilustres personalidades que han contribuido al desarrollo y progreso de nuestro país.